全体として下記の症状です。詳細は各疾患で異なります。また同じ疾患でも個人差があります。
| 発達遅滞・知的障害(95%) | 運動発達の遅れ(55%) |
| 言語の遅れ、発語なし(71%) |
筋緊張低下(59%) |
| てんかん(57%) | 側湾症など整形学的問題(36%) |
| 脳構造の異常(40%) | 視力、眼科的疾患(44%) |
| 自閉症スペクトラム、ASD・ADHD・不安(60%) | 各疾患ごとの特徴的な顔立ち(65%) |



*略語で記載 例)HNRNPH2=H2、HNRNPU=Uなど
| HNRNP | H2 | K | Q | R | U | H1 |
| てんかん発作 | + | まれ | ++ | ++ | 95% | + |
| 脳構造の異常 | 小脳発育不全 | 50% | +(脳室拡大症) | +(異常な脳横細線) | +(薄い脳横細線) | + |
| 睡眠障害 | + | + | ||||
| 筋緊張の異常 | +(亢進) | +++ | + | ++ | + | |
| 筋無力症 | + | 45% | ||||
| ADHD | 15% | 44% | ||||
| ASD | 33% | まれ | ++ | ++ | 33% |
| HNRNP | H2 | K | Q | R | U | H1 |
| 成長の遅れ | ++ | まれ | + | + | + | |
| 手足の異常 | 扁平足 | |||||
| 指の異常 | + | + | + | |||
| 歩行の異常 | + | |||||
| 側わん症 | + | ++ | + | + | まれ | + |
| 関節の過度な可動性 | + | + | + | まれ |
| HNRNP | H2 | K | Q | R | U | H1 |
| 頭蓋縫合早期閉鎖症、異常成長 | +(50%、23%) | |||||
| 顔の形 | +(丸い) | +(細長い) | +(丸い) | |||
| 形態異常的な特徴 | + | ++ | + | + | ||
| 聴力喪失 | 23% | |||||
| 耳の異常 | + | + | ||||
| 眼瞼下垂 | まれ | + | ||||
| 異常な眼瞼裂 | + | ++ | ||||
| 斜視 | 54% | + | 30% | + | ||
| 視覚の問題 | + | + | + | 30% | + |
| HNRNP | H2 | K | Q | R | U | H1 |
| 腎臓疾患 | ++ | まれ | ||||
| 尿道逆流 | ++ | |||||
| 尿道下裂 | ++ | 52% | + | |||
| 便秘 | + | + | + | |||
| 逆流性食道炎 | + | + | ||||
| 呼吸の異常 | + | |||||
| 睡眠時無呼吸症候群 | + | |||||
| 停留精巣 | 76% | + | + | + | ||
| 摂食障害 | 67% | + | + | 58% | ||
| 先天性心疾患 | まれ | 62% | まれ | 30% |